Background selection

Zusammenfassung

Hitchhiking-Effekte werden nicht nur von starker, positiv gerichteter oder balancierender Selektion verursacht, sondern können auch die Folge von starker, negativ gerichteter (purifizierender) Selektion sein. Im letzteren Fall führt dies zur Eliminierung von nachteiligen Allelen, wobei aber rekurrente schädliche Mutationen dafür sorgen, dass solche Allele in natürlichen Populationen in einem Mutations-Selektions-Gleichgewicht erhalten bleiben und somit einen wichtigen Evolutionsfaktor darstellen. In diesem Kapitel werden wir zunächst den hitchhiking-Effekt dieser stark nachteiligen Allele auf gekoppelte neutrale DNA-Varianten im Genom analysieren. Dieser wird als background selection bezeichnet. Wir werden zeigen, dass background selection die neutrale genetische Variabilität reduzieren kann. Danach werden wir die beiden Mechanismen background selection und selective sweeps, die beide zu einer Verringerung der genetischen Variation an gekoppelten Nukleotidstellen führen, vergleichen. Schließlich werden wir die hitchhiking-Effekte von vorteilhaften und nachteiligen Allelen, d. h. selective sweeps und background selection, gemeinsam behandeln und zur Analyse von Polymorphismusdaten verwenden.