Skip to main content
SpringerLink
Log in

Genomforschung und Bioinformatik

  • Chapter
Krebsforschung heute

  • 65 Accesses

Zusammenfassung

Die Gesamtheit der genetischen Informationen, die im Erbgut verankert sind, nennen wir das menschliche Genom. Die rasche Entwicklung der Molekulargenetik in den letzten Jahren hat uns in die Lage versetzt, die Ursachen von Krankheiten auf der molekularen Ebene zu analysieren und zu verstehen. Insbesondere haben wir gelernt, daß Krebserkrankungen eng mit Veränderungen am Genom verknüpft sind. Wir wissen auch, daß das menschliche Genom eine Länge von drei Milliarden molekularer Bausteine hat und in 44 Autosomen (nicht geschlechtsgebundene Chromosomen) und zwei Geschlechtschromosomen aufgeteilt ist. Wegen der Fülle an hochkomplexen Daten, die sich bei der Analyse des Genoms ansammeln, arbeiten Biologen und Genetiker in diesem Forschungsschwerpunkt mit Informatikern und Mathematikern eng zusammen. Mit Hilfe des Computers speichern sie einerseits die bereits entschlüsselten Teilabschnitte der Erbsubstanz und versuchen, aus diesen Puzzlestücken das Gesamtbild der einzelnen Chromosomen richtig zusammenzusetzen. Andererseits verwenden sie biophysikalische Methoden, um die räumliche Struktur und biologische Funktion der einzelnen Gene zu modellieren und zu analysieren. Da die Genprodukte, auch Eiweißmoleküle genannt, nach dem exakten Bauplan der Natur eine wohldefinierte und für die jeweilige Funktion optimierte Raumstruktur aufweisen, schlägt sich ein Fehler in der genomischen Bausteinsequenz auch in der Konstruktion des abgeleiteten Genprodukts nieder. Besonders wichtig wird das Wissen um die Folgen solcher Konstruktionsfehler dann, wenn gerade das fehlerhafte Eiweiß für krebshemmende oder krebsfördernde Funktionen verantwortlich ist.

This is a preview of subscription content, log in via an institution to check access.

Access this chapter

Log in via an institution
Chapter
USD 29.95
Price excludes VAT (USA)
  • Available as PDF
  • Read on any device
  • Instant download
  • Own it forever
eBook
USD 49.99
Price excludes VAT (USA)
  • Available as PDF
  • Read on any device
  • Instant download
  • Own it forever
Softcover Book
USD 84.99
Price excludes VAT (USA)
  • Compact, lightweight edition
  • Dispatched in 3 to 5 business days
  • Free shipping worldwide - see info

Tax calculation will be finalised at checkout

Purchases are for personal use only

Institutional subscriptions

Preview

Unable to display preview. Download preview PDF.

Unable to display preview. Download preview PDF.

Literatur

Ausgewählte Publikationen

  • Bentz, M., Schröder, M., Herz, M., Stilgenbauer, S., Lichter, P., Döhner, H.: Detection of trisomy 8 on blood smears using fluorescence in situ hybridization. Leukemia 7, 752–757 (1993)

    PubMed  CAS  Google Scholar 

  • Joos, S., Scherthan, H., Speicher, M. R., Schlegel, J., Cremer, T, Lichter, P.: Detection of amplified genomic sequences by reverse chromosome painting using genomic tumor DNA as probe. Hum. Genet. 90, 584–589 (1993)

    Article  PubMed  CAS  Google Scholar 

  • Du Manoir, S., Schröck, E., Bentz, M., Speicher, M. R., Joos, S., Ried, T, Lichter, P., Cremer, T: Quantitative analysis of comparative genomic hybridization. Cytometry 19, 27–41 (1995)

    Article  PubMed  Google Scholar 

  • Lichter, R, Bentz, M., Joos, S.: Detection of chromosomal aberrations by means of molecular cytogenetics: Painting of chromosomes and chromosomal subregions and comparative genomic hybridization. Methods Enzym. 254, 334–359 (1995)

    Article  CAS  Google Scholar 

  • Joos, S., Bergerheim, U. S. R., Pan, Y., Matsuyama, H., Bentz, M., du Manoir, S., Lichter, P.: Mapping of chromosomal gains and losses in prostate cancer by comparative genomic hybridization. Genes Chromosom. Cancer 14, 167–276(1995)

    Google Scholar 

  • Joos, S., Otano-Joos, M. I., Ziegler, S., Brüderlein, S., du Manoir, S., Bentz, M., Möller, P., Lichter, P.: Primary mediastinal (thymic) B-cell lymphoma is characterized by gains of chromosomal material including 9p and of the REL gene. Blood 87, 1571–1578 (1996)

    PubMed  CAS  Google Scholar 

  • Bentz, M., Werner, C. A., Döhner, H., Joos, S., Barth, T F. E., Siebert, R., Schröder, M., Stilgenbauer, S., Fischer, K., Möller, R, Lichter, P.: High incidences of chromosomal imbalances and gene amplifications in the classical follicular variant of follicle center lymphoma. Blood 88, 1437–1444 (1996)

    PubMed  CAS  Google Scholar 

  • Weber, R. G., Sabel, M., Reifenberger, J., Sommer, C., Oberstrass, J., Reifenberger, G., Kiessling, M., Cremer, T: Characterization of genomic alterations associated with glioma progression by comparative genomic hybridization. Oncogene 13, 983–994 (1996)

    PubMed  CAS  Google Scholar 

  • Solinas-Toldo, S., Dürst, M., Lichter, R: Specific chromosomal imbalances in human papillomavirus transfected cells during progressions towards immortality Proc. Natl. Acad. Sci. USA 94, 3854–3859(1997)

    CAS  Google Scholar 

Ausgewählte Publikationen

  • Meier-Ewert, S., Maier, E., Ahmadi, A., Curtis, J., Lehrach, H.: An automated approach to generating expressed sequence catalogues. Nature 361, 375–376 (1993)

    Article  PubMed  CAS  Google Scholar 

  • Zehetner, G., Lehrach, H.: The Reference Library System — sharing biological material and experimental data. Nature 367, 489–491 (1994)

    Article  PubMed  CAS  Google Scholar 

  • Chumakov, I.M., Rigault, Ph., Le Gall, I., Cohen, D. et al.: A YAC contig map of the human genome. Nature, 377 (Supp.) 175–299 (1995)

    PubMed  CAS  Google Scholar 

  • Dib, C., Faure, S., Fizames, C., Weissenbach, J. et al.: A comprehensive genetic map of the human genome based on 5264 microsatellites. Nature 380, 152–154 (1996)

    Article  PubMed  CAS  Google Scholar 

  • Goffeau, A., Barell, B.G., Bussey H., Oliver, S.G. et al.: Life with 6000 genes. Science 274, 546–567 (1996)

    Article  PubMed  CAS  Google Scholar 

  • Heiss, N.S., Rogner, U.C., Kioschis, P., Korn, B., Poustka, A.: Transcriptional mapping in a 700 kb region around the DXS52 locus in Xq28: isolation of six novel transcripts and a novel ATPase isoform (hPMCA5). Genome Res. 6, 478–491 (1996)

    Article  PubMed  CAS  Google Scholar 

  • Kahn, P.: German genome program. The right mix of form and function. Science 273, 570–571 (1996)

    Article  PubMed  CAS  Google Scholar 

  • Kioschis, P, Rogner, U.C., Pick, E., Klauck, S.M., Heiss, N., Siebenhaar, R., Korn, B., Coy J.F., Laporte, J., Liechti-Gaiiati, S., Poustka, A.: A 900 kb cosmid contig and eleven new transcripts within the candiadte region for myotubular myopathy (MTM1). Genomics 33, 365–373 (1996)

    Article  PubMed  CAS  Google Scholar 

  • Group 1: Laporte, J., Hu, L.J., Kretz, C, and Mandel, J.L. Group 2: Kioschis, P., Coy, J.F., Klauck, S.M., and Poustka, A. Group 3: Dahl, N.: A gene mutated in X-linked myotubular myopathy defines a new putative tyrosine phosphatase family conserved in yeast. Nat. Genet. 13, 175–182 (1996)

    Article  PubMed  CAS  Google Scholar 

  • Miklos, G.L., Rubin, G.M.: The role of the genome project in determining gene function: insights from model organisms. Cell. 86, 521–529(1996)

    Article  PubMed  CAS  Google Scholar 

  • Rogner, U.C., Heiss, N.S., Kioschis, P, Wiemann, S., Korn, B., Poustka, A.: Transcriptional analysis of the candidate region for incontinentia pigmenti (IP2) in Xq28. Genome Research 6, 922–934(1996)

    Article  PubMed  CAS  Google Scholar 

  • Schüler, G.D., Boguski, M.S., Stewart, E.A., Hudson, T.J. et al.: A gene map of the human genome. Science 274, 540–546 (1996)

    Article  PubMed  Google Scholar 

Ausgewählte Publikationen

  • Klenin, K., Frank-Kamenetskii, M. D., Langowski, J.: Modulation of intramolecular interactions in superhelical DNA by curved sequences: a Monte-Carlo simulation study Biophys. J., 68, 81–88(1995)

    CAS  Google Scholar 

  • Rippe, K., Hippel, P. H. v., Langowski, J.: Action at a distance: the effect of DNA looping on the local protein concentration. Trends- Biochem.Sci. 20, 500–506 (1995)

    Article  PubMed  CAS  Google Scholar 

  • Chirico, G., Langowski, J.: Brownian dynamics simulations of supercoiled DNA with bent sequences. Biophys. J., 71, 955–971 (1996)

    CAS  Google Scholar 

  • Cremen C., Münkel, C., Granzow, M., Jauch, A., Dietzel, S., Eils, R., Guan, X.-Y., Meitzer, P.S., Trent, J.M., Langowski, J., Cremer, T: Nuclear architecture and the induction of chromosomal aberrations. Mutation Res. 366, 97–116(1996)

    Article  Google Scholar 

  • Ehrlich, L., Münkel, C., Chirico, G., Langowski, J.: A Brownian dynamics model for the chromatin fiber. CABIOS 13, 271–279 (1997)

    PubMed  CAS  Google Scholar 

Ausgewählte Publikationen

  • Gress, TM., Hoheisel, J.D., Lennon, G.G., Zehetner, G., Lehrach, H.: Hybridisation fingerprinting of high density cDNA-library arrays with cDNA pools derived from whole tissues. Mamm. Genomes 3, 609–619 (1992)

    CAS  Google Scholar 

  • Hoheisel, J.D.: Application of hybridization techniques to genome mapping and sequencing. Trends Genet. 10, 79–83 (1994)

    Article  PubMed  CAS  Google Scholar 

  • Goffeau, A., Barrel!, B.G., Bussey H., Davis, R.W., Dujon, B., Feldmann, H., Galibert, R, Hoheisel, J.D., Jacq, C., Johnston, M., Louis, E.J., Mewes, H.W., Murakami, Y, Philippsen, P., Tettelin, H., Oliver, S.G.: Life with 6000 genes. Science 274, 546–567 (1996)

    Article  PubMed  CAS  Google Scholar 

  • Hoheisel, J.D.: Sequence-independent and linear variation of oligonucleotide DNA-binding stabilities. Nucleic Acids Res. 24, 430–432 (1996)

    Article  PubMed  CAS  Google Scholar 

  • Weiler, J., Hauser, N., Hoheisel, J.D.: New developments in oligomer array technologies. Nucl. & Nucl. 16, 777–780(1997)

    Article  CAS  Google Scholar 

  • Weiler, J., Hoheisel, J.D.: Combining the preparation of oligonucleotide arrays and synthesis of high quality primers. Anal. Biochem. 243, 218–227(1996)

    CAS  Google Scholar 

  • Hoheisel, J.D.: Oligomer chip technology Trends Biotechnol. 15, 465–469 (1997)

    Article  CAS  Google Scholar 

Download references

Authors
  1. Ruthild Weber
    View author publications

    You can also search for this author in PubMed Google Scholar

  2. Peter Lichter
    View author publications

    You can also search for this author in PubMed Google Scholar

  3. Petra Kioschis
    View author publications

    You can also search for this author in PubMed Google Scholar

  4. Jörg Langowski
    View author publications

    You can also search for this author in PubMed Google Scholar

  5. Nicole Hauser
    View author publications

    You can also search for this author in PubMed Google Scholar

  6. Marcel Scheideler
    View author publications

    You can also search for this author in PubMed Google Scholar

  7. Jörg D. Hoheisel
    View author publications

    You can also search for this author in PubMed Google Scholar

Editor information

Editors and Affiliations

    Rights and permissions

    Reprints and permissions

    Copyright information

    © 1998 Springer-Verlag Berlin Heidelberg

    About this chapter

    Cite this chapter

    Weber, R. et al. (1998). Genomforschung und Bioinformatik. In: Krebsforschung heute. Steinkopff, Heidelberg. https://doi.org/10.1007/978-3-642-87241-9_11

    Download citation

    • DOI: https://doi.org/10.1007/978-3-642-87241-9_11

    • Publisher Name: Steinkopff, Heidelberg

    • Print ISBN: 978-3-7985-1105-7

    • Online ISBN: 978-3-642-87241-9

    • eBook Packages: Springer Book Archive

    Publish with us

    Policies and ethics

    Search

    Navigation