Parameteroptimierung in CSMP

Zusammenfassung

Zur Parameteroptimierung eignen sich am ehesten die direkten Suchverfahren nach Hooke und Jeeves bzw. Bremermann, wenn es wesentlich darauf ankommt, trotz unvorhersehbarer Eigenschaften der Zielfunktion auch bei schlechten Anfangsschätzungen der Parameter mit möglichst wenigen Zielfunktionsauswertungen eine grobe Annäherung an das Optimum zu erreichen. Die Optimierung von Simulationsmodellen biologischer Regulationssysteme gehört zu dieser Problemkategorie. Es werden die Schritte dargestellt, die zu einem lauffähigen Parameteroptimierungs-Unterprogramm für die Simulationssprache CSMP führen.

Summary

For optimizing the parameters of simulation models of biological regulatory systems one needs methods that despite only very raw initial values and ill-behaved object functions achieve a rough approximation to the optimum with as few as possible evaluations of the object function. The methods of Hooke and Jeeves and of Bremermann are suited best for that purpose. The steps leading to an executable optimization subroutine for the CSMP simulation system are described.