Abstract
Bone diagenesis is a set of processes by which the organic and mineral phases and the structure of bone are transformed during fossilization. To understand how these processes have affected skeletal material recovered from Azokh Caves (particularly the organic preservation), we measured ‘diagenetic parameters’ of skeletal material from Holocene, Late Pleistocene and Middle Pleistocene deposits from Azokh Caves. Additionally, we used this study to further test the application of both nitrogen adsorption isotherm analysis and mercury intrusion porosimetry for measuring the porosity of fossil bone. The skeletal material from the Pleistocene layers of Azokh Caves can be characterized as generally poorly preserved (especially collagen preservation). Porosity values of the bones are lower than might be expected as many bones show evidence of extensive infilling of the pores with secondary minerals. The pore infilling in the Middle Pleistocene layers is most extensive and this type of preservation has not previously been described in archaeological material.
Резюме
Диагенез костей – это совокупность процессов, в результате которых органические и минеральные составляющие структуры кости трансформируются благодаря распаду и фоссилизации. Чтобы понять, как эти процессы воздействовали на скелетный материал, обнаруженный в Азохской пещере (и, в частности, оценить степень сохранности органических веществ в костях), были измерены определенные “диагенетические параметры” скелетного материала. Тридцать три кости из трех главных участков Азохской пещеры были исследованы для выяснения степени сохранности в зависимости от места находки и возраста образца. Голоценовый материал из Азох 2 был сопоставлен с костями из Азох 1 (подразделения II–III – поздний плейстоцен и средние горизонты подразделения V – средний плейстоцен).
Мы оценили количество коллагена, оставшегося в костях после деминерализации, и степень сохранности минералов с использованием метода FTIR (инфракрасная спектроскопия на основе преобразования Фурье). Изменения на поверхности костей и гистологическая структура поперечного сечения были исследованы с помощью обычного светового и сканирующего электронного микроскопов с электронной информационной системой (EDS). Степень гистологической сохранности была оценена с использованием шкалы Oxford Histological Index. Изменения в пористости костей были измерены с помощью изотермального анализа поглощения азота (NAIA) и ртутной интрузионной порометрии (HgIP), а результаты этих двух методов в дальнейшем были сопоставлены.
Согласно величинам “диагенетических параметров”, материал из Азох 2 представлял собой смесь из хорошо сохранившегося материала и костей, которые лишились коллагена химическим путем, а также некоторых костей, потерявших коллаген из-за микробного воздействия. Мы объясняем этот конгломерат различных типов сохранности как возможный результат смешения современного и ископаемого материала на поверхностных слоях Азох 2. Скелетный материал из плейстоценовых слоев Азох 1 в целом плохо сохранился. Содержание коллагена бедное, с большими изменениями в кристалличности структуры. Результаты гистологического исследования и анализа на пористость показывают, что во многих случаях кости лишились коллагена по причине химической деградации, хотя потеря коллагена, вызванная микробами, также может быть значительной, особенно в подразделениях II–III. Степень пористости костей оказалась ниже, чем ожидалось, учитывая показатели потери коллагена и микробного воздействия. Многие кости имеют обширную заполненность пор вторичными минералами. Содержание пор в среднеплейстоценовых горизонтах наиболее экстенсивное, и данный тип сохранности ранее не был описан в археологическом материале.
Обнаруженные уровни коллагена как показателя сохранности органического материала свидетельствуют о низком содержании древней ДНК (aDNA) в пещере; более того, сильно измененные минералы костей также оставляют мало надежд на сохранность aDNA.
Данное исследование представляет собой интересный пример сравнения двух методов измерения пористости. Оно показало, что поры диаметром ниже порога чувствительности метода HgIP, но исследованные с помощью NAIA (с диаметром пор меньше 0,1мкм), возникли по причине потери коллагена; они заполняются таким же образом, как и поры диаметром 0,01–0,1мкм.
Access this chapter
Tax calculation will be finalised at checkout
Purchases are for personal use only
References
Appendix: Fernández-Jalvo, Y., Ditchfield, P., Grün, R., Lees, W., Aubert, M., Torres, T., et al. (2016). Dating methods applied to Azokh cave sites. In Y. Fernández-Jalvo, T. King, L. Yepiskoposyan & P. Andrews (Eds.), Azokh Cave and the Transcaucasian Corridor (pp. 1–26). Dordrecht: Springer.
Barrett, E. P., Joyner, L. G., & Halenda, P. P. (1951). The determination of pore volume and area distributions in porous substances. I. Computations from nitrogen isotherms. Journal of the American Chemical Society, 73, 373–380.
Bennett, E. A., Gorgé, O., Grange, T., Fernández-Jalvo, Y., & Geigl, E.-M. (2016). Coprolites, paleogenomics and bone content analysis. In Y. Fernández-Jalvo, T. King, L. Yepiskoposyan & P. Andrews (Eds.), Azokh Cave and the Transcaucasian Corridor (pp. 271–286). Dordrecht: Springer.
Bosch, P., Alemán, I., Moreno-Castilla, C., & Botella, M. (2011). Boiled versus unboiled: A study on Neolithic and contemporary human bones. Journal of Archaeological Science, 38, 2561–2570.
Brock, F., Higham, T., & Bronk Ramsey, C. (2010). Pre-screening techniques for identification of samples suitable for radiocarbon dating of poorly preserved bones. Journal of Archaeological Science, 37, 855–865.
Collins, M. J., Nielsen-Marsh, C. M., Hiller, J., Smith, C. I., Roberts, J. P., Prigodich, R. V., et al. (2002). The survival of organic matter in bone: A review. Archaeometry, 44, 383–394.
Colson, I., Bailey, J. F., Vercauteren, M., Sykes, B., & Hedges, R. E. M. (1997). The preservation of ancient DNA and bone diagenesis. Ancient Biomolecules, 1, 109–117.
DeNiro, M. J. (1985). Postmortem preservation and alteration of in vivo bone collagen isotope ratios in relation to palaeodietary reconstruction. Nature, 317, 806–809.
Domínguez-Alonso, P., Aracil, E., Porres, J. A., Andrews, P., Lynch, E. P., & Murray, J. (2016). Geology and geomorphology of Azokh Caves. In Y. Fernández-Jalvo, T. King, L. Yepiskoposyan & P. Andrews (Eds.), Azokh Cave and the Transcaucasian Corridor (pp. 55–84). Dordrecht: Springer.
Fernández-Jalvo, Y., Andrews, P., Pesquero, D., Smith, C., Marin-Monfort, D., Sánchez, B., et al. (2010a). Early bone diagenesis in temperate environments Part I: Surface features and histology. Palaeogeography, Palaeoclimatology, Palaeoecology, 288, 62–81.
Fernández-Jalvo, Y., King, T., Andrews, P., Yepiskoposyan, L., Moloney, N., Murray, J., et al. (2010b). The Azokh Cave complex: Middle Pleistocene to Holocene human occupation in the Caucasus. Journal of Human Evolution, 58, 103–109.
Fernández-Jalvo, Y., King, T., Yepiskoposyan, Y., & Andrews, P. (2016). Introduction: Azokh Cave and the Transcaucasian Corridor. In Y. Fernández-Jalvo, T. King, L. Yepiskoposyan & P. Andrews (Eds.), Azokh Cave and the Transcaucasian Corridor (pp. 1–26). Dordrecht: Springer.
Geigl, E.-M. (2002). On the circumstances surrounding the preservation and analysis of very old DNA. Archaeometry, 44, 337–342.
Gilbert, M. T. P., Rudbeck, L., Willerslev, E., Hansen, A. J., Smith, C., Penkman, K., et al. (2005). Biochemical and physical correlates of DNA contamination in archaeological human bones and teeth excavated at Matera, Italy. Journal of Archaeological Science, 32, 785–793.
Götherström, A., Angerbjorn, A., Collins, M. J., & Liden, K. (2002). Bone preservation and DNA amplification. Archaeometry, 44, 395–404.
Gutierrez, M. A. (2001). Bone diagenesis and taphonomic history of the Paso Otero 1 Bone Bed, Pampas of Argentina. Journal of Archaeological Science, 28, 1277–1290.
Haynes, S., Searle, J. B., Bertman, A., & Dobney, K. M. (2002). Bone preservation and ancient DNA: The application of screening methods for predicting DNA. Journal of Archaeological Science, 29, 585–592.
Hedges, R. E. M. (2002). Bone diagenesis: An overview of processes. Archaeometry, 44, 319–328.
Hedges, R. E. M., & Millard, A. R. (1995). Bones and groundwater: Towards the modelling of diagenetic processes. Journal of Archaeological Science, 22, 155–164.
Hedges, R. E. M., Millard, A. R., & Pike, A. W. G. (1995). Measurements and relationships of diagenetic alteration of bone from three archaeological sites. Journal of Archaeological Science, 22, 201–209.
Jans, M. M. E., Nielsen-Marsh, C. M., Smith, C. I., Collins, M. J., & Kars, H. (2004). Characterisation of microbial attack on archaeological bone. Journal of Archaeological Science, 31, 87–95.
Joschek, S., Nies, B., Krotz, R., & Gopferich, A. (2000). Chemical and physico-chemical characterization of porous hydroxy-apatite ceramics made of natural bone. Biomaterials, 21, 1645–1658.
Kars, E. A. K., & Kars, H. (2002). The degradation of bone as an indicator in the deterioration of the European Archaeological Heritage – Final Report. (ISBN 90-5799-029-6).
Kasimova, R. M. (2001). Anthropological research of Azykh Man osseous remains. Human Evolution, 16, 37–44.
King, T., Compton, T., Rosas, A., Andrews, P. Yepiskoyan, L., & Asryan, L. (2016). Azokh cave Hominin Remains. In Y. Fernández-Jalvo, T. King, L. Yepiskoposyan & P. Andrews (Eds.), Azokh Cave and the Transcaucasian Corridor (pp. 103–106). Dordrecht: Springer.
Marin-Monfort, M. D., Cáceres, I., Andrews, P., Pinto, A. C., & Fernández-Jalvo, Y. (2016). Taphonomy and site formation of Azokh 1. In Y. Fernández-Jalvo, T. King, L. Yepiskoposyan & P. Andrews (Eds.), Azokh Cave and the Transcaucasian Corridor (pp. 211–249). Dordrecht: Springer.
Millard, A. R. (2001). Deterioration of bone. In D. Brothwell & A. M. Pollard (Eds.), Handbook of archaeological sciences (pp. 633–643). Chichester: Wiley.
Murray, J., Domínguez-Alonso, P., Fernández-Jalvo, Y., King, T., Lynch, E. P., Andrews, P., et al. (2010). Pleistocene to Holocene stratigraphy of Azokh 1 Cave, Lesser Caucasus. Irish Journal of Earth Sciences, 28, 75–91.
Murray, J., Lynch, E. P., Domínguez-Alonso, P., & Barham, M. (2016). Stratigraphy and sedimentology of Azokh Caves, South Caucasus. In Y. Fernández-Jalvo, T. King, L. Yepiskoposyan & P. Andrews (Eds.), Azokh Cave and the Transcaucasian Corridor (pp. 27–54). Dordrecht: Springer.
Nielsen-Marsh, C. M., & Hedges, R. E. M. (1999). Bone Porosity and the use of Mercury intrusion porosimetry in bone diagenesis studies. Archaeometry, 41, 165–174.
Nielsen-Marsh, C. M., Smith, C. I., Jans, M., Nord, A., Kars, H., & Collins, M. J. (2007). Bone diagenesis in the European Holocene II: Taphonomic and environmental considerations. Journal of Archaeological Science, 34, 1523–1531.
Pruvost, M., Schwarz, R., Bessa Correia, V., Champlot, S., Braguier, S., Morel, N., et al. (2007). Freshly excavated fossil bones are best for amplification of ancient DNA. Proceedings of the National Academy of Sciences USA, 104, 739–744.
Roberts, S. J., Smith, C. I., Millard, A. R., & Collins, M. J. (2002). The taphonomy of cooked bone: Characterising boiling and its physico-chemical effects. Archaeometry, 44, 485–494.
Robinson, S., Nicholson, R. A., Pollard, A. M., & O’Connor, T. P. (2003). An evaluation of nitrogen porosimetry as a technique for predicting taphonomic durability in animal bone. Journal of Archaeological Science, 30, 391–403.
Smith, C. I., Nielsen-Marsh, C. M., Jans, M. M. E., Arthur, P., Nord, A. G., & Collins, M. J. (2002). The Strange case of Apigliano: Early ‘Fossilisation’ of medieval bone in southern Italy. Archaeometry, 44, 405–415.
Smith, C. I., Nielsen-Marsh, C. M., Jans, M. M. E., & Collins, M. J. (2007). Bone diagenesis in the European Holocene I: Patterns and mechanisms. Journal of Archaeological Science, 34, 1485–1493.
Smith, C. I., Faraldos, M., & Fernández-Jalvo, Y. (2008). The precision of porosity measurements: Effects of sample pre-treatment on porosity measurements of modern and archaeological bone. Palaeogeography, Palaeoclimatology, Palaeoecology, 266, 175–182.
Trueman, C. N., & Martill, D. M. (2002). The long-term survival of bone: The role of bioerosion. Archaeometry, 44, 371–382.
Trueman, C. N., & Tuross, N. (2002). Trace elements in recent and fossil bone apatite. Reviews in Mineralogy and Geochemistry, 48, 489–521.
Trueman, C. N. G., Behrensmeyer, A. K., Tuross, N., & Weiner, S. (2004). Mineralogical and compositional changes in bones exposed on soil surfaces in Amboseli National Park, Kenya: Diagenetic mechanisms and the role of sediment pore fluids. Journal of Archaeological Science, 31, 721–739.
Turner-Walker, G., Nielsen-Marsh, C. M., Syversen, U., Kars, H., & Collins, M. J. (2002). Sub-micron spongiform porosity is the major ultra-structural alteration occurring in archaeological bone. International Journal of Osteoarchaeology, 12, 407–414.
Tuross, N. (1993). The other molecules in ancient bone: Noncollagenous proteins and DNA. In J. B. Lambert & G. Grupe (Eds.), Prehistoric human bone: Archaeology at the molecular level (pp. 275–292). Dordrecht: Springer.
Weiner, S., & Bar-Yosef, O. (1990). States of preservation of bones from prehistoric sites in the Near-East: A survey. Journal of Archaeological Science, 17, 187–196.
Acknowledgements
This investigation was carried out as part of a Marie Curie Training Fellowship awarded to CS (Contract Number: HPMF-CT-2002-01605), and has benefited from funding from two research projects of the Spanish Ministry of Science (BTE2003-01552 and CGL2007-66231). Nitrogen adsorption isotherm analysis and mercury intrusion porosimetry, and FTIR analysis were carried out at the Unidad de Apoyo a la Investigación del Instituto de Catálisis y Petroleoquímica and C:N analyses were undertaken at the Facultad de Ciencias at the Universidad Autónoma de Madrid. Thanks to the technicians of the Electron Microscopy Unit of the Museo Nacional de Ciencias Naturales.
Author information
Authors and Affiliations
Corresponding author
Editor information
Editors and Affiliations
Rights and permissions
Copyright information
© 2016 Springer Science+Business Media Dordrecht
About this chapter
Cite this chapter
Smith, C.I., Faraldos, M., Fernández-Jalvo, Y. (2016). Bone Diagenesis at Azokh Caves. In: Fernández-Jalvo, Y., King, T., Yepiskoposyan, L., Andrews, P. (eds) Azokh Cave and the Transcaucasian Corridor. Vertebrate Paleobiology and Paleoanthropology. Springer, Cham. https://doi.org/10.1007/978-3-319-24924-7_11
Download citation
DOI: https://doi.org/10.1007/978-3-319-24924-7_11
Published:
Publisher Name: Springer, Cham
Print ISBN: 978-3-319-24922-3
Online ISBN: 978-3-319-24924-7
eBook Packages: Earth and Environmental ScienceEarth and Environmental Science (R0)