Guinney J, Dienstmann R, Wang X, et al (2015) Nat Med 21:1350–6 The consensus molecular subtypes of colorectal cancer

Résumé

Le cancer colorectal (CCR) est une affection fréquemment fatale, mais associée à une évolution et à une réponse au traitement variable. Afin de clarifier les classifications moléculaires des CCR, reposant sur l’expression de gènes, et faciliter l’intégration de celles-ci en pratique clinique, un consortium international de groupes d’experts a été créé, avec l’objectif de partager les données existantes et leur analyse. Un regroupement des six classifications indépendantes déjà existantes en quatre groupes a pu être objectivé. Ces quatre groupes présentent des caractéristiques propres: CMS1, qualifié d’« immun », observé dans 14 % des cas, caractérisé par une instabilité microsatellitaire, un fort taux de mutations et une forte activation immunitaire; CMS2, observé dans 37%des cas, qualifié de « canonique », avec des caractéristiques épithéliales, présentant une dérégulation de la voie WNT/MYC; CMS3 dénommé « métabolique », observé dans 13 % des cas, présentant une dérégulation épithéliale et métabolique; CMS4 ou « mésenchymateux », observé dans 13 % des cas, caractérisé par des phénomènes de transition épithéliomésenchymateuse, avec une implication du stroma, de l’angiogenèse et de la voie TGFβ. Un cinquième groupe non classé a été identifié, représentant possiblement un groupe de transition ou d’hétérogénéité intratumorale. Les auteurs considèrent que les groupes CMS représentent la meilleure classification moléculaire actuellement disponible des CCR, avec une signification biologique forte. Ils peuvent constituer la base pour une future stratification clinique, notamment en matière de ciblage thérapeutique.

Abstract

Colorectal cancer (CRC) is a frequently lethal disease with heterogeneous outcomes and drug responses. To resolve inconsistencies among the reported gene expression-based CRC classifications and facilitate clinical translation, we formed an international consortium dedicated to large-scale data sharing and analytics across expert groups. We show marked interconnectivity between six independent classification systems coalescing into four consensus molecular subtypes (CMSs) with distinguishing features: CMS1 (microsatellite instability immune, 14%), hypermutated, microsatellite unstable, and strong immune activation; CMS2 (canonical, 37%), epithelial, marked WNT and MYC signaling activation; CMS3 (metabolic, 13%), epithelial and evident metabolic dysregulation; and CMS4 (mesenchymal, 23%), prominent transforming growth factor–activation, stromal invasion and angiogenesis. Samples with mixed features (13%) possibly represent a transition phenotype or intratumoral heterogeneity. We consider the CMS groups the most robust classification system currently available for CRC — with clear biological interpretability and the basis for future clinical stratification and subtype-based targeted interventions.